Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gga1Q8R0H9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gga1Q8R0H9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gga1Q8R0H9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gga1Q8R0H9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gga1Q8R0H9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gga1Q8R0H9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gga1Q8R0H9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gga1Q8R0H9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gga1Q8R0H9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gga1Q8R0H9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gga1Q8R0H9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Gga1Q8R0H9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gga1Q8R0H9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gga1Q8R0H9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gga1Q8R0H9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gga1Q8R0H9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gga1Q8R0H9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gga1Q8R0H9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gga1Q8R0H9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gga1Q8R0H9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gga1Q8R0H9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gga1Q8R0H9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gga1Q8R0H9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gga1Q8R0H9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gga1Q8R0H9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gga1Q8R0H9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gga1Q8R0H9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gga1Q8R0H9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gga1Q8R0H9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gga1Q8R0H9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga1Q8R0H9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga1Q8R0H9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga1Q8R0H9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gga1Q8R0H9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gga1Q8R0H9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gga1Q8R0H9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Gga1Q8R0H9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gga1Q8R0H9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gga1Q8R0H9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gga1Q8R0H9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gga1Q8R0H9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gga1Q8R0H9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gga1Q8R0H9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gga1Q8R0H9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gga1Q8R0H9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gga1Q8R0H9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gga1Q8R0H9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gga1Q8R0H9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gga1Q8R0H9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms