Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb12Q8K4N3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defb12Q8K4N3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defb12Q8K4N3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb12Q8K4N3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defb12Q8K4N3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms