Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Matr3Q8K310 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Matr3Q8K310 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Matr3Q8K310 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Matr3Q8K310 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Matr3Q8K310 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Matr3Q8K310 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Matr3Q8K310 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Matr3Q8K310 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Matr3Q8K310 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Matr3Q8K310 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Matr3Q8K310 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Matr3Q8K310 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Matr3Q8K310 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Matr3Q8K310 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Matr3Q8K310 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Matr3Q8K310 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Matr3Q8K310 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Matr3Q8K310 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Matr3Q8K310 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Matr3Q8K310 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Matr3Q8K310 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Matr3Q8K310 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Matr3Q8K310 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Matr3Q8K310 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Matr3Q8K310 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Matr3Q8K310 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Matr3Q8K310 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Matr3Q8K310 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Matr3Q8K310 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Matr3Q8K310 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Matr3Q8K310 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Matr3Q8K310 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Matr3Q8K310 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Matr3Q8K310 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Matr3Q8K310 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Matr3Q8K310 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Matr3Q8K310 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Matr3Q8K310 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Matr3Q8K310 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms