Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcf3Q8K268 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcf3Q8K268 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcf3Q8K268 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcf3Q8K268 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcf3Q8K268 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcf3Q8K268 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcf3Q8K268 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcf3Q8K268 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcf3Q8K268 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf3Q8K268 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcf3Q8K268 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcf3Q8K268 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf3Q8K268 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcf3Q8K268 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcf3Q8K268 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcf3Q8K268 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcf3Q8K268 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcf3Q8K268 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcf3Q8K268 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcf3Q8K268 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcf3Q8K268 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcf3Q8K268 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcf3Q8K268 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms