Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nek9Q8K1R7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nek9Q8K1R7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nek9Q8K1R7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nek9Q8K1R7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nek9Q8K1R7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Nek9Q8K1R7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nek9Q8K1R7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nek9Q8K1R7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nek9Q8K1R7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nek9Q8K1R7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nek9Q8K1R7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nek9Q8K1R7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nek9Q8K1R7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nek9Q8K1R7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Nek9Q8K1R7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nek9Q8K1R7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nek9Q8K1R7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nek9Q8K1R7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nek9Q8K1R7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nek9Q8K1R7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Nek9Q8K1R7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nek9Q8K1R7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Nek9Q8K1R7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nek9Q8K1R7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nek9Q8K1R7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nek9Q8K1R7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nek9Q8K1R7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nek9Q8K1R7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nek9Q8K1R7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nek9Q8K1R7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nek9Q8K1R7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nek9Q8K1R7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nek9Q8K1R7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nek9Q8K1R7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nek9Q8K1R7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Nek9Q8K1R7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nek9Q8K1R7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nek9Q8K1R7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nek9Q8K1R7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nek9Q8K1R7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nek9Q8K1R7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nek9Q8K1R7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nek9Q8K1R7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nek9Q8K1R7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nek9Q8K1R7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nek9Q8K1R7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nek9Q8K1R7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nek9Q8K1R7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nek9Q8K1R7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nek9Q8K1R7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nek9Q8K1R7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nek9Q8K1R7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nek9Q8K1R7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nek9Q8K1R7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nek9Q8K1R7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nek9Q8K1R7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Nek9Q8K1R7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nek9Q8K1R7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nek9Q8K1R7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nek9Q8K1R7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nek9Q8K1R7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nek9Q8K1R7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nek9Q8K1R7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek9Q8K1R7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nek9Q8K1R7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nek9Q8K1R7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nek9Q8K1R7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nek9Q8K1R7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nek9Q8K1R7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nek9Q8K1R7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nek9Q8K1R7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nek9Q8K1R7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nek9Q8K1R7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nek9Q8K1R7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms