Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ago4Q8CJF8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ago4Q8CJF8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ago4Q8CJF8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ago4Q8CJF8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ago4Q8CJF8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ago4Q8CJF8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ago4Q8CJF8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ago4Q8CJF8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ago4Q8CJF8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ago4Q8CJF8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ago4Q8CJF8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ago4Q8CJF8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ago4Q8CJF8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ago4Q8CJF8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ago4Q8CJF8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ago4Q8CJF8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ago4Q8CJF8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ago4Q8CJF8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ago4Q8CJF8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ago4Q8CJF8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ago4Q8CJF8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ago4Q8CJF8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ago4Q8CJF8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ago4Q8CJF8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ago4Q8CJF8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ago4Q8CJF8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ago4Q8CJF8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ago4Q8CJF8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ago4Q8CJF8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ago4Q8CJF8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ago4Q8CJF8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ago4Q8CJF8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ago4Q8CJF8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ago4Q8CJF8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ago4Q8CJF8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ago4Q8CJF8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ago4Q8CJF8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ago4Q8CJF8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ago4Q8CJF8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ago4Q8CJF8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ago4Q8CJF8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ago4Q8CJF8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ago4Q8CJF8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ago4Q8CJF8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ago4Q8CJF8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ago4Q8CJF8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ago4Q8CJF8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ago4Q8CJF8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ago4Q8CJF8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ago4Q8CJF8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ago4Q8CJF8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ago4Q8CJF8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms