Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIB5

Fermt2, Fermitin family homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt2Q8CIB5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fermt2Q8CIB5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fermt2Q8CIB5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fermt2Q8CIB5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fermt2Q8CIB5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fermt2Q8CIB5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fermt2Q8CIB5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fermt2Q8CIB5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fermt2Q8CIB5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fermt2Q8CIB5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fermt2Q8CIB5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fermt2Q8CIB5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fermt2Q8CIB5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fermt2Q8CIB5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fermt2Q8CIB5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fermt2Q8CIB5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fermt2Q8CIB5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fermt2Q8CIB5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fermt2Q8CIB5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fermt2Q8CIB5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fermt2Q8CIB5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fermt2Q8CIB5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fermt2Q8CIB5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fermt2Q8CIB5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fermt2Q8CIB5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fermt2Q8CIB5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fermt2Q8CIB5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fermt2Q8CIB5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fermt2Q8CIB5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fermt2Q8CIB5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fermt2Q8CIB5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fermt2Q8CIB5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fermt2Q8CIB5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Fermt2Q8CIB5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fermt2Q8CIB5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fermt2Q8CIB5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fermt2Q8CIB5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fermt2Q8CIB5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fermt2Q8CIB5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fermt2Q8CIB5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fermt2Q8CIB5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fermt2Q8CIB5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fermt2Q8CIB5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fermt2Q8CIB5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fermt2Q8CIB5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fermt2Q8CIB5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fermt2Q8CIB5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fermt2Q8CIB5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Fermt2Q8CIB5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fermt2Q8CIB5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fermt2Q8CIB5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fermt2Q8CIB5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fermt2Q8CIB5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fermt2Q8CIB5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fermt2Q8CIB5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fermt2Q8CIB5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms