Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Rapgef2Q8CHG7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rapgef2Q8CHG7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rapgef2Q8CHG7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Rapgef2Q8CHG7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Rapgef2Q8CHG7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rapgef2Q8CHG7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rapgef2Q8CHG7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rapgef2Q8CHG7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Rapgef2Q8CHG7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Rapgef2Q8CHG7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Rapgef2Q8CHG7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rapgef2Q8CHG7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Rapgef2Q8CHG7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Rapgef2Q8CHG7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rapgef2Q8CHG7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Rapgef2Q8CHG7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Rapgef2Q8CHG7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Rapgef2Q8CHG7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Rapgef2Q8CHG7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Rapgef2Q8CHG7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Rapgef2Q8CHG7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Rapgef2Q8CHG7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Rapgef2Q8CHG7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rapgef2Q8CHG7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rapgef2Q8CHG7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rapgef2Q8CHG7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rapgef2Q8CHG7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Rapgef2Q8CHG7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
Rapgef2Q8CHG7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
Rapgef2Q8CHG7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rapgef2Q8CHG7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rapgef2Q8CHG7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rapgef2Q8CHG7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rapgef2Q8CHG7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Rapgef2Q8CHG7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rapgef2Q8CHG7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
Rapgef2Q8CHG7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Rapgef2Q8CHG7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Rapgef2Q8CHG7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Rapgef2Q8CHG7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Rapgef2Q8CHG7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rapgef2Q8CHG7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Rapgef2Q8CHG7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rapgef2Q8CHG7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rapgef2Q8CHG7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rapgef2Q8CHG7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rapgef2Q8CHG7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rapgef2Q8CHG7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
Rapgef2Q8CHG7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rapgef2Q8CHG7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Rapgef2Q8CHG7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rapgef2Q8CHG7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Rapgef2Q8CHG7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rapgef2Q8CHG7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Rapgef2Q8CHG7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rapgef2Q8CHG7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rapgef2Q8CHG7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rapgef2Q8CHG7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Rapgef2Q8CHG7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Rapgef2Q8CHG7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rapgef2Q8CHG7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rapgef2Q8CHG7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rapgef2Q8CHG7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rapgef2Q8CHG7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rapgef2Q8CHG7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rapgef2Q8CHG7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rapgef2Q8CHG7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rapgef2Q8CHG7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rapgef2Q8CHG7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rapgef2Q8CHG7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rapgef2Q8CHG7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rapgef2Q8CHG7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rapgef2Q8CHG7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rapgef2Q8CHG7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rapgef2Q8CHG7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rapgef2Q8CHG7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Rapgef2Q8CHG7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rapgef2Q8CHG7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rapgef2Q8CHG7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rapgef2Q8CHG7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rapgef2Q8CHG7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rapgef2Q8CHG7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rapgef2Q8CHG7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rapgef2Q8CHG7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rapgef2Q8CHG7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Rapgef2Q8CHG7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rapgef2Q8CHG7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Rapgef2Q8CHG7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Rapgef2Q8CHG7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rapgef2Q8CHG7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rapgef2Q8CHG7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rapgef2Q8CHG7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rapgef2Q8CHG7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rapgef2Q8CHG7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rapgef2Q8CHG7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rapgef2Q8CHG7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rapgef2Q8CHG7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rapgef2Q8CHG7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Rapgef2Q8CHG7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms