Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Chic1Q8CBW7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
Chic1Q8CBW7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
Chic1Q8CBW7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Chic1Q8CBW7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Chic1Q8CBW7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Chic1Q8CBW7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Chic1Q8CBW7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Chic1Q8CBW7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
Chic1Q8CBW7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Chic1Q8CBW7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Chic1Q8CBW7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Chic1Q8CBW7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Chic1Q8CBW7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Chic1Q8CBW7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Chic1Q8CBW7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Chic1Q8CBW7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
Chic1Q8CBW7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Chic1Q8CBW7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Chic1Q8CBW7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Chic1Q8CBW7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Chic1Q8CBW7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Chic1Q8CBW7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Chic1Q8CBW7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Chic1Q8CBW7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Chic1Q8CBW7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Chic1Q8CBW7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Chic1Q8CBW7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Chic1Q8CBW7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Chic1Q8CBW7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Chic1Q8CBW7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Chic1Q8CBW7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Chic1Q8CBW7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Chic1Q8CBW7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Chic1Q8CBW7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Chic1Q8CBW7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Chic1Q8CBW7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Chic1Q8CBW7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Chic1Q8CBW7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Chic1Q8CBW7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Chic1Q8CBW7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Chic1Q8CBW7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Chic1Q8CBW7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
Chic1Q8CBW7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Chic1Q8CBW7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Chic1Q8CBW7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Chic1Q8CBW7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
Chic1Q8CBW7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Chic1Q8CBW7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Chic1Q8CBW7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Chic1Q8CBW7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Chic1Q8CBW7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Chic1Q8CBW7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Chic1Q8CBW7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Chic1Q8CBW7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Chic1Q8CBW7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Chic1Q8CBW7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
Chic1Q8CBW7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Chic1Q8CBW7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Chic1Q8CBW7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Chic1Q8CBW7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Chic1Q8CBW7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Chic1Q8CBW7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Chic1Q8CBW7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Chic1Q8CBW7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Chic1Q8CBW7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Chic1Q8CBW7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
Chic1Q8CBW7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Chic1Q8CBW7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Chic1Q8CBW7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Chic1Q8CBW7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Chic1Q8CBW7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Chic1Q8CBW7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Chic1Q8CBW7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Chic1Q8CBW7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Chic1Q8CBW7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Chic1Q8CBW7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Chic1Q8CBW7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Chic1Q8CBW7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms