Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ephb1Q8CBF3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ephb1Q8CBF3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ephb1Q8CBF3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ephb1Q8CBF3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ephb1Q8CBF3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ephb1Q8CBF3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ephb1Q8CBF3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ephb1Q8CBF3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ephb1Q8CBF3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ephb1Q8CBF3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ephb1Q8CBF3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ephb1Q8CBF3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ephb1Q8CBF3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ephb1Q8CBF3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ephb1Q8CBF3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ephb1Q8CBF3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ephb1Q8CBF3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb1Q8CBF3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb1Q8CBF3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb1Q8CBF3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb1Q8CBF3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb1Q8CBF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ephb1Q8CBF3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb1Q8CBF3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb1Q8CBF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb1Q8CBF3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ephb1Q8CBF3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb1Q8CBF3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms