Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc186Q8C9S4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Ccdc186Q8C9S4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ccdc186Q8C9S4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ccdc186Q8C9S4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ccdc186Q8C9S4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ccdc186Q8C9S4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ccdc186Q8C9S4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ccdc186Q8C9S4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ccdc186Q8C9S4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,64■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ccdc186Q8C9S4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc186Q8C9S4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc186Q8C9S4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ccdc186Q8C9S4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc186Q8C9S4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc186Q8C9S4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc186Q8C9S4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc186Q8C9S4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccdc186Q8C9S4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccdc186Q8C9S4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc186Q8C9S4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc186Q8C9S4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc186Q8C9S4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc186Q8C9S4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ccdc186Q8C9S4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ccdc186Q8C9S4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ccdc186Q8C9S4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ccdc186Q8C9S4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ccdc186Q8C9S4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ccdc186Q8C9S4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc186Q8C9S4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc186Q8C9S4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc186Q8C9S4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc186Q8C9S4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc186Q8C9S4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc186Q8C9S4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc186Q8C9S4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc186Q8C9S4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc186Q8C9S4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc186Q8C9S4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,3 ms