Protein–RNA interactions for Protein: Q8C262

Irgc, Interferon-inducible GTPase 5, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IrgcQ8C262 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IrgcQ8C262 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IrgcQ8C262 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IrgcQ8C262 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IrgcQ8C262 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IrgcQ8C262 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IrgcQ8C262 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IrgcQ8C262 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IrgcQ8C262 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IrgcQ8C262 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IrgcQ8C262 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IrgcQ8C262 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IrgcQ8C262 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IrgcQ8C262 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IrgcQ8C262 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IrgcQ8C262 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IrgcQ8C262 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms