Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg16l1Q8C0J2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg16l1Q8C0J2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg16l1Q8C0J2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg16l1Q8C0J2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg16l1Q8C0J2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg16l1Q8C0J2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg16l1Q8C0J2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg16l1Q8C0J2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg16l1Q8C0J2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atg16l1Q8C0J2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg16l1Q8C0J2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg16l1Q8C0J2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg16l1Q8C0J2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg16l1Q8C0J2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg16l1Q8C0J2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg16l1Q8C0J2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg16l1Q8C0J2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg16l1Q8C0J2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg16l1Q8C0J2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms