Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trerf1Q8BXJ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trerf1Q8BXJ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trerf1Q8BXJ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trerf1Q8BXJ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trerf1Q8BXJ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trerf1Q8BXJ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trerf1Q8BXJ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trerf1Q8BXJ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trerf1Q8BXJ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trerf1Q8BXJ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trerf1Q8BXJ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trerf1Q8BXJ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trerf1Q8BXJ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trerf1Q8BXJ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trerf1Q8BXJ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trerf1Q8BXJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
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