Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrfn5Q8BXA0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrfn5Q8BXA0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrfn5Q8BXA0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrfn5Q8BXA0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrfn5Q8BXA0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrfn5Q8BXA0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrfn5Q8BXA0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrfn5Q8BXA0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrfn5Q8BXA0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrfn5Q8BXA0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrfn5Q8BXA0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrfn5Q8BXA0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrfn5Q8BXA0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrfn5Q8BXA0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrfn5Q8BXA0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrfn5Q8BXA0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrfn5Q8BXA0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrfn5Q8BXA0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrfn5Q8BXA0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrfn5Q8BXA0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrfn5Q8BXA0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrfn5Q8BXA0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrfn5Q8BXA0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrfn5Q8BXA0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrfn5Q8BXA0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrfn5Q8BXA0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms