Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia2Q8BSS9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia2Q8BSS9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfia2Q8BSS9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia2Q8BSS9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia2Q8BSS9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia2Q8BSS9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia2Q8BSS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia2Q8BSS9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfia2Q8BSS9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia2Q8BSS9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia2Q8BSS9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia2Q8BSS9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia2Q8BSS9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfia2Q8BSS9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfia2Q8BSS9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfia2Q8BSS9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfia2Q8BSS9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia2Q8BSS9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia2Q8BSS9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia2Q8BSS9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia2Q8BSS9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia2Q8BSS9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia2Q8BSS9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia2Q8BSS9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia2Q8BSS9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia2Q8BSS9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia2Q8BSS9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia2Q8BSS9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia2Q8BSS9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia2Q8BSS9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia2Q8BSS9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia2Q8BSS9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia2Q8BSS9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia2Q8BSS9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia2Q8BSS9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia2Q8BSS9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia2Q8BSS9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia2Q8BSS9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms