Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LsampQ8BLK3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LsampQ8BLK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LsampQ8BLK3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LsampQ8BLK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LsampQ8BLK3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LsampQ8BLK3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LsampQ8BLK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LsampQ8BLK3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LsampQ8BLK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LsampQ8BLK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LsampQ8BLK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LsampQ8BLK3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LsampQ8BLK3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LsampQ8BLK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LsampQ8BLK3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LsampQ8BLK3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LsampQ8BLK3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LsampQ8BLK3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LsampQ8BLK3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LsampQ8BLK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LsampQ8BLK3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LsampQ8BLK3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LsampQ8BLK3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LsampQ8BLK3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LsampQ8BLK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LsampQ8BLK3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LsampQ8BLK3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LsampQ8BLK3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LsampQ8BLK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LsampQ8BLK3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LsampQ8BLK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LsampQ8BLK3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LsampQ8BLK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LsampQ8BLK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms