Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PolrmtQ8BKF1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PolrmtQ8BKF1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PolrmtQ8BKF1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PolrmtQ8BKF1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PolrmtQ8BKF1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PolrmtQ8BKF1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PolrmtQ8BKF1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PolrmtQ8BKF1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PolrmtQ8BKF1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PolrmtQ8BKF1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PolrmtQ8BKF1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PolrmtQ8BKF1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PolrmtQ8BKF1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PolrmtQ8BKF1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PolrmtQ8BKF1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PolrmtQ8BKF1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PolrmtQ8BKF1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PolrmtQ8BKF1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PolrmtQ8BKF1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PolrmtQ8BKF1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PolrmtQ8BKF1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PolrmtQ8BKF1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PolrmtQ8BKF1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PolrmtQ8BKF1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PolrmtQ8BKF1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PolrmtQ8BKF1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PolrmtQ8BKF1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PolrmtQ8BKF1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PolrmtQ8BKF1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PolrmtQ8BKF1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PolrmtQ8BKF1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PolrmtQ8BKF1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PolrmtQ8BKF1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PolrmtQ8BKF1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PolrmtQ8BKF1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PolrmtQ8BKF1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PolrmtQ8BKF1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PolrmtQ8BKF1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PolrmtQ8BKF1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PolrmtQ8BKF1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PolrmtQ8BKF1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PolrmtQ8BKF1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PolrmtQ8BKF1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms