Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc40Q8BI79 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc40Q8BI79 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc40Q8BI79 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ccdc40Q8BI79 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ccdc40Q8BI79 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ccdc40Q8BI79 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ccdc40Q8BI79 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ccdc40Q8BI79 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Ccdc40Q8BI79 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc40Q8BI79 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ccdc40Q8BI79 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ccdc40Q8BI79 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ccdc40Q8BI79 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Ccdc40Q8BI79 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Ccdc40Q8BI79 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ccdc40Q8BI79 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,72
Ccdc40Q8BI79 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Ccdc40Q8BI79 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ccdc40Q8BI79 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ccdc40Q8BI79 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ccdc40Q8BI79 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ccdc40Q8BI79 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ccdc40Q8BI79 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc40Q8BI79 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc40Q8BI79 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc40Q8BI79 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc40Q8BI79 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc40Q8BI79 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc40Q8BI79 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,4 ms