Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Katnb1Q8BG40 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katnb1Q8BG40 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katnb1Q8BG40 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katnb1Q8BG40 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Katnb1Q8BG40 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Katnb1Q8BG40 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Katnb1Q8BG40 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Katnb1Q8BG40 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Katnb1Q8BG40 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Katnb1Q8BG40 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Katnb1Q8BG40 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katnb1Q8BG40 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Katnb1Q8BG40 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Katnb1Q8BG40 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katnb1Q8BG40 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Katnb1Q8BG40 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Katnb1Q8BG40 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Katnb1Q8BG40 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Katnb1Q8BG40 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Katnb1Q8BG40 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms