Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD8

Prap1, Proline-rich acidic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prap1Q80XD8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prap1Q80XD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prap1Q80XD8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prap1Q80XD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prap1Q80XD8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prap1Q80XD8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prap1Q80XD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prap1Q80XD8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prap1Q80XD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prap1Q80XD8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prap1Q80XD8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prap1Q80XD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prap1Q80XD8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prap1Q80XD8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prap1Q80XD8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prap1Q80XD8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prap1Q80XD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prap1Q80XD8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prap1Q80XD8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prap1Q80XD8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prap1Q80XD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prap1Q80XD8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prap1Q80XD8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prap1Q80XD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms