Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Srrm3Q80WV7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Srrm3Q80WV7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srrm3Q80WV7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srrm3Q80WV7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srrm3Q80WV7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srrm3Q80WV7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srrm3Q80WV7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Srrm3Q80WV7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Srrm3Q80WV7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Srrm3Q80WV7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srrm3Q80WV7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srrm3Q80WV7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srrm3Q80WV7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Srrm3Q80WV7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srrm3Q80WV7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srrm3Q80WV7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srrm3Q80WV7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srrm3Q80WV7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Srrm3Q80WV7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Srrm3Q80WV7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srrm3Q80WV7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srrm3Q80WV7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srrm3Q80WV7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srrm3Q80WV7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srrm3Q80WV7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srrm3Q80WV7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srrm3Q80WV7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srrm3Q80WV7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srrm3Q80WV7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srrm3Q80WV7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Srrm3Q80WV7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srrm3Q80WV7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Srrm3Q80WV7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srrm3Q80WV7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srrm3Q80WV7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms