Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh3b1Q80VQ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aldh3b1Q80VQ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh3b1Q80VQ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh3b1Q80VQ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh3b1Q80VQ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh3b1Q80VQ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh3b1Q80VQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh3b1Q80VQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh3b1Q80VQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh3b1Q80VQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh3b1Q80VQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh3b1Q80VQ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh3b1Q80VQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh3b1Q80VQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh3b1Q80VQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh3b1Q80VQ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh3b1Q80VQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh3b1Q80VQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh3b1Q80VQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh3b1Q80VQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh3b1Q80VQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh3b1Q80VQ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh3b1Q80VQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms