Protein–RNA interactions for Protein: Q80UQ2

Rassf6, Ras association domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf6Q80UQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rassf6Q80UQ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rassf6Q80UQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rassf6Q80UQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rassf6Q80UQ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rassf6Q80UQ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rassf6Q80UQ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rassf6Q80UQ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rassf6Q80UQ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rassf6Q80UQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rassf6Q80UQ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rassf6Q80UQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rassf6Q80UQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rassf6Q80UQ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rassf6Q80UQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rassf6Q80UQ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rassf6Q80UQ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rassf6Q80UQ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rassf6Q80UQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rassf6Q80UQ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rassf6Q80UQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rassf6Q80UQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rassf6Q80UQ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rassf6Q80UQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rassf6Q80UQ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf6Q80UQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rassf6Q80UQ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rassf6Q80UQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rassf6Q80UQ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf6Q80UQ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf6Q80UQ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf6Q80UQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf6Q80UQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf6Q80UQ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rassf6Q80UQ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rassf6Q80UQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf6Q80UQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rassf6Q80UQ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf6Q80UQ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf6Q80UQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rassf6Q80UQ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rassf6Q80UQ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rassf6Q80UQ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rassf6Q80UQ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rassf6Q80UQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rassf6Q80UQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf6Q80UQ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rassf6Q80UQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rassf6Q80UQ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rassf6Q80UQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rassf6Q80UQ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rassf6Q80UQ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rassf6Q80UQ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rassf6Q80UQ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms