Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamp3Q7TST5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamp3Q7TST5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamp3Q7TST5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamp3Q7TST5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamp3Q7TST5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamp3Q7TST5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamp3Q7TST5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lamp3Q7TST5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamp3Q7TST5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamp3Q7TST5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms