Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClmQ7TSN2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClmQ7TSN2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClmQ7TSN2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmQ7TSN2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmQ7TSN2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClmQ7TSN2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClmQ7TSN2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClmQ7TSN2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClmQ7TSN2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClmQ7TSN2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClmQ7TSN2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClmQ7TSN2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClmQ7TSN2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClmQ7TSN2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClmQ7TSN2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClmQ7TSN2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClmQ7TSN2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClmQ7TSN2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClmQ7TSN2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClmQ7TSN2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClmQ7TSN2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClmQ7TSN2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms