Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Tubb2aQ7TMM9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Tubb2aQ7TMM9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Tubb2aQ7TMM9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Tubb2aQ7TMM9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Tubb2aQ7TMM9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Tubb2aQ7TMM9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Tubb2aQ7TMM9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26,7■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Tubb2aQ7TMM9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Tubb2aQ7TMM9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Tubb2aQ7TMM9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Tubb2aQ7TMM9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Tubb2aQ7TMM9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Tubb2aQ7TMM9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Tubb2aQ7TMM9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Tubb2aQ7TMM9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Tubb2aQ7TMM9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Tubb2aQ7TMM9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Tubb2aQ7TMM9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Tubb2aQ7TMM9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Tubb2aQ7TMM9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Tubb2aQ7TMM9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Tubb2aQ7TMM9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Tubb2aQ7TMM9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tubb2aQ7TMM9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Tubb2aQ7TMM9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Tubb2aQ7TMM9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,45■■□□□ 1,83
Tubb2aQ7TMM9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,7 ms