Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4bQ7M729 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4bQ7M729 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn4bQ7M729 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4bQ7M729 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4bQ7M729 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn4bQ7M729 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn4bQ7M729 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn4bQ7M729 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn4bQ7M729 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn4bQ7M729 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn4bQ7M729 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn4bQ7M729 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn4bQ7M729 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn4bQ7M729 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn4bQ7M729 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn4bQ7M729 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn4bQ7M729 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn4bQ7M729 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn4bQ7M729 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn4bQ7M729 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn4bQ7M729 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn4bQ7M729 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms