Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Brd2Q7JJ13 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Brd2Q7JJ13 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Brd2Q7JJ13 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brd2Q7JJ13 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brd2Q7JJ13 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brd2Q7JJ13 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Brd2Q7JJ13 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Brd2Q7JJ13 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brd2Q7JJ13 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brd2Q7JJ13 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Brd2Q7JJ13 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Brd2Q7JJ13 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Brd2Q7JJ13 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Brd2Q7JJ13 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brd2Q7JJ13 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brd2Q7JJ13 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Brd2Q7JJ13 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Brd2Q7JJ13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brd2Q7JJ13 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Brd2Q7JJ13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brd2Q7JJ13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brd2Q7JJ13 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brd2Q7JJ13 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brd2Q7JJ13 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Brd2Q7JJ13 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brd2Q7JJ13 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brd2Q7JJ13 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brd2Q7JJ13 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Brd2Q7JJ13 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brd2Q7JJ13 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brd2Q7JJ13 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brd2Q7JJ13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brd2Q7JJ13 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brd2Q7JJ13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brd2Q7JJ13 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brd2Q7JJ13 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brd2Q7JJ13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brd2Q7JJ13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brd2Q7JJ13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brd2Q7JJ13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Brd2Q7JJ13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Brd2Q7JJ13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brd2Q7JJ13 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brd2Q7JJ13 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brd2Q7JJ13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brd2Q7JJ13 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Brd2Q7JJ13 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Brd2Q7JJ13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brd2Q7JJ13 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms