Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SpopQ6ZWS8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SpopQ6ZWS8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SpopQ6ZWS8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SpopQ6ZWS8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SpopQ6ZWS8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SpopQ6ZWS8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SpopQ6ZWS8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SpopQ6ZWS8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SpopQ6ZWS8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SpopQ6ZWS8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SpopQ6ZWS8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SpopQ6ZWS8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SpopQ6ZWS8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SpopQ6ZWS8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SpopQ6ZWS8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SpopQ6ZWS8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SpopQ6ZWS8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SpopQ6ZWS8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SpopQ6ZWS8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SpopQ6ZWS8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SpopQ6ZWS8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SpopQ6ZWS8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SpopQ6ZWS8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SpopQ6ZWS8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SpopQ6ZWS8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SpopQ6ZWS8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SpopQ6ZWS8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SpopQ6ZWS8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SpopQ6ZWS8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SpopQ6ZWS8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SpopQ6ZWS8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SpopQ6ZWS8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SpopQ6ZWS8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SpopQ6ZWS8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SpopQ6ZWS8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SpopQ6ZWS8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpopQ6ZWS8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpopQ6ZWS8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SpopQ6ZWS8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SpopQ6ZWS8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms