Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp2r2bQ6ZWR4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2r2bQ6ZWR4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp2r2bQ6ZWR4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2r2bQ6ZWR4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2r2bQ6ZWR4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp2r2bQ6ZWR4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp2r2bQ6ZWR4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp2r2bQ6ZWR4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp2r2bQ6ZWR4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms