Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Igsf3Q6ZQA6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Igsf3Q6ZQA6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Igsf3Q6ZQA6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Igsf3Q6ZQA6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Igsf3Q6ZQA6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Igsf3Q6ZQA6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Igsf3Q6ZQA6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Igsf3Q6ZQA6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Igsf3Q6ZQA6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Igsf3Q6ZQA6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Igsf3Q6ZQA6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Igsf3Q6ZQA6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Igsf3Q6ZQA6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Igsf3Q6ZQA6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Igsf3Q6ZQA6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Igsf3Q6ZQA6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Igsf3Q6ZQA6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Igsf3Q6ZQA6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Igsf3Q6ZQA6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Igsf3Q6ZQA6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Igsf3Q6ZQA6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Igsf3Q6ZQA6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Igsf3Q6ZQA6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Igsf3Q6ZQA6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Igsf3Q6ZQA6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Igsf3Q6ZQA6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Igsf3Q6ZQA6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms