Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
March6Q6ZQ89 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
March6Q6ZQ89 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
March6Q6ZQ89 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
March6Q6ZQ89 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
March6Q6ZQ89 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
March6Q6ZQ89 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
March6Q6ZQ89 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
March6Q6ZQ89 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
March6Q6ZQ89 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
March6Q6ZQ89 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
March6Q6ZQ89 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
March6Q6ZQ89 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
March6Q6ZQ89 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
March6Q6ZQ89 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
March6Q6ZQ89 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
March6Q6ZQ89 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
March6Q6ZQ89 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
March6Q6ZQ89 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
March6Q6ZQ89 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
March6Q6ZQ89 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
March6Q6ZQ89 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
March6Q6ZQ89 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
March6Q6ZQ89 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
March6Q6ZQ89 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
March6Q6ZQ89 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
March6Q6ZQ89 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
March6Q6ZQ89 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
March6Q6ZQ89 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
March6Q6ZQ89 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
March6Q6ZQ89 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
March6Q6ZQ89 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
March6Q6ZQ89 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
March6Q6ZQ89 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
March6Q6ZQ89 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
March6Q6ZQ89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
March6Q6ZQ89 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
March6Q6ZQ89 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.55■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.54■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.53■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
March6Q6ZQ89 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
March6Q6ZQ89 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
March6Q6ZQ89 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
March6Q6ZQ89 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
March6Q6ZQ89 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms