Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
NinlQ6ZQ12 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35,57■■■■□ 3,28
NinlQ6ZQ12 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
NinlQ6ZQ12 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35,54■■■■□ 3,28
NinlQ6ZQ12 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
NinlQ6ZQ12 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
NinlQ6ZQ12 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,5■■■■□ 3,27
NinlQ6ZQ12 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
NinlQ6ZQ12 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35,45■■■■□ 3,27
NinlQ6ZQ12 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
NinlQ6ZQ12 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
NinlQ6ZQ12 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35,41■■■■□ 3,26
NinlQ6ZQ12 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,4■■■■□ 3,26
NinlQ6ZQ12 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
NinlQ6ZQ12 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
NinlQ6ZQ12 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
NinlQ6ZQ12 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
NinlQ6ZQ12 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
NinlQ6ZQ12 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
NinlQ6ZQ12 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
NinlQ6ZQ12 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
NinlQ6ZQ12 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35,28■■■■□ 3,24
NinlQ6ZQ12 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,28■■■■□ 3,24
NinlQ6ZQ12 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
NinlQ6ZQ12 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
NinlQ6ZQ12 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
NinlQ6ZQ12 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,24
NinlQ6ZQ12 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
NinlQ6ZQ12 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
NinlQ6ZQ12 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
NinlQ6ZQ12 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35,21■■■■□ 3,23
NinlQ6ZQ12 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
NinlQ6ZQ12 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35,19■■■■□ 3,22
NinlQ6ZQ12 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
NinlQ6ZQ12 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
NinlQ6ZQ12 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35,16■■■■□ 3,22
NinlQ6ZQ12 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35,16■■■■□ 3,22
NinlQ6ZQ12 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,12■■■■□ 3,21
NinlQ6ZQ12 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
NinlQ6ZQ12 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
NinlQ6ZQ12 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
NinlQ6ZQ12 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35,07■■■■□ 3,2
NinlQ6ZQ12 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
NinlQ6ZQ12 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
NinlQ6ZQ12 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
NinlQ6ZQ12 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
NinlQ6ZQ12 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
NinlQ6ZQ12 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
NinlQ6ZQ12 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34,99■■■■□ 3,19
NinlQ6ZQ12 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34,99■■■■□ 3,19
NinlQ6ZQ12 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
NinlQ6ZQ12 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
NinlQ6ZQ12 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
NinlQ6ZQ12 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34,94■■■■□ 3,18
NinlQ6ZQ12 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,93■■■■□ 3,18
NinlQ6ZQ12 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,92■■■■□ 3,18
NinlQ6ZQ12 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,92■■■■□ 3,18
NinlQ6ZQ12 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
NinlQ6ZQ12 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
NinlQ6ZQ12 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34,91■■■■□ 3,18
NinlQ6ZQ12 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
NinlQ6ZQ12 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
NinlQ6ZQ12 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
NinlQ6ZQ12 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
NinlQ6ZQ12 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
NinlQ6ZQ12 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
NinlQ6ZQ12 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
NinlQ6ZQ12 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
NinlQ6ZQ12 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,82■■■■□ 3,17
NinlQ6ZQ12 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34,82■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
NinlQ6ZQ12 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34,75■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34,75■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,74■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34,74■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,7■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
NinlQ6ZQ12 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
NinlQ6ZQ12 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
NinlQ6ZQ12 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
NinlQ6ZQ12 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
NinlQ6ZQ12 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34,66■■■■□ 3,14
NinlQ6ZQ12 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
NinlQ6ZQ12 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34,65■■■■□ 3,14
NinlQ6ZQ12 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
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