Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPF4

Fmnl3, Formin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl3Q6ZPF4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Fmnl3Q6ZPF4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Fmnl3Q6ZPF4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Fmnl3Q6ZPF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Fmnl3Q6ZPF4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Fmnl3Q6ZPF4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Fmnl3Q6ZPF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Fmnl3Q6ZPF4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Fmnl3Q6ZPF4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Fmnl3Q6ZPF4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Fmnl3Q6ZPF4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Fmnl3Q6ZPF4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Fmnl3Q6ZPF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Fmnl3Q6ZPF4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Fmnl3Q6ZPF4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Fmnl3Q6ZPF4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Fmnl3Q6ZPF4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Fmnl3Q6ZPF4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Fmnl3Q6ZPF4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Fmnl3Q6ZPF4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Fmnl3Q6ZPF4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Fmnl3Q6ZPF4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Fmnl3Q6ZPF4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Fmnl3Q6ZPF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Fmnl3Q6ZPF4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Fmnl3Q6ZPF4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Fmnl3Q6ZPF4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Fmnl3Q6ZPF4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Fmnl3Q6ZPF4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Fmnl3Q6ZPF4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Fmnl3Q6ZPF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Fmnl3Q6ZPF4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Fmnl3Q6ZPF4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Fmnl3Q6ZPF4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Fmnl3Q6ZPF4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Fmnl3Q6ZPF4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Fmnl3Q6ZPF4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Fmnl3Q6ZPF4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,7 ms