Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shc4Q6S5L9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shc4Q6S5L9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shc4Q6S5L9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shc4Q6S5L9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shc4Q6S5L9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shc4Q6S5L9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shc4Q6S5L9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shc4Q6S5L9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shc4Q6S5L9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shc4Q6S5L9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shc4Q6S5L9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shc4Q6S5L9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shc4Q6S5L9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shc4Q6S5L9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shc4Q6S5L9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shc4Q6S5L9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shc4Q6S5L9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shc4Q6S5L9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shc4Q6S5L9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shc4Q6S5L9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shc4Q6S5L9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms