Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
GmipQ6PGG2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,87■■■□□ 2,05
GmipQ6PGG2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
GmipQ6PGG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,87■■■□□ 2,05
GmipQ6PGG2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
GmipQ6PGG2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
GmipQ6PGG2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
GmipQ6PGG2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
GmipQ6PGG2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
GmipQ6PGG2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
GmipQ6PGG2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
GmipQ6PGG2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
GmipQ6PGG2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
GmipQ6PGG2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,78■■■□□ 2,04
GmipQ6PGG2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
GmipQ6PGG2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
GmipQ6PGG2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
GmipQ6PGG2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
GmipQ6PGG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
GmipQ6PGG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
GmipQ6PGG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27,72■■■□□ 2,03
GmipQ6PGG2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,7■■■□□ 2,03
GmipQ6PGG2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
GmipQ6PGG2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
GmipQ6PGG2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
GmipQ6PGG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
GmipQ6PGG2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
GmipQ6PGG2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
GmipQ6PGG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
GmipQ6PGG2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
GmipQ6PGG2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
GmipQ6PGG2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
GmipQ6PGG2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
GmipQ6PGG2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
GmipQ6PGG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,55■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27,53■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
GmipQ6PGG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
GmipQ6PGG2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
GmipQ6PGG2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
GmipQ6PGG2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
GmipQ6PGG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
GmipQ6PGG2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
GmipQ6PGG2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
GmipQ6PGG2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
GmipQ6PGG2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
GmipQ6PGG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
GmipQ6PGG2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
GmipQ6PGG2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
GmipQ6PGG2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,35■■□□□ 1,97
GmipQ6PGG2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
GmipQ6PGG2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,35■■□□□ 1,97
GmipQ6PGG2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
GmipQ6PGG2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
GmipQ6PGG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
GmipQ6PGG2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
GmipQ6PGG2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
GmipQ6PGG2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
GmipQ6PGG2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
GmipQ6PGG2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
GmipQ6PGG2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
GmipQ6PGG2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
GmipQ6PGG2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
GmipQ6PGG2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
GmipQ6PGG2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
GmipQ6PGG2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,1 ms