Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrt3Q6PE13 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prrt3Q6PE13 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prrt3Q6PE13 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrt3Q6PE13 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prrt3Q6PE13 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrt3Q6PE13 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrt3Q6PE13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrt3Q6PE13 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrt3Q6PE13 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prrt3Q6PE13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrt3Q6PE13 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prrt3Q6PE13 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prrt3Q6PE13 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prrt3Q6PE13 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrt3Q6PE13 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prrt3Q6PE13 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prrt3Q6PE13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrt3Q6PE13 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrt3Q6PE13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prrt3Q6PE13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrt3Q6PE13 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrt3Q6PE13 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrt3Q6PE13 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrt3Q6PE13 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrt3Q6PE13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrt3Q6PE13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrt3Q6PE13 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrt3Q6PE13 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prrt3Q6PE13 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prrt3Q6PE13 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prrt3Q6PE13 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrt3Q6PE13 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrt3Q6PE13 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrt3Q6PE13 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrt3Q6PE13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrt3Q6PE13 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrt3Q6PE13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrt3Q6PE13 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prrt3Q6PE13 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prrt3Q6PE13 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms