Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Kdm2bQ6P1G2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Kdm2bQ6P1G2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Kdm2bQ6P1G2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Kdm2bQ6P1G2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Kdm2bQ6P1G2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
Kdm2bQ6P1G2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Kdm2bQ6P1G2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Kdm2bQ6P1G2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Kdm2bQ6P1G2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Kdm2bQ6P1G2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Kdm2bQ6P1G2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Kdm2bQ6P1G2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Kdm2bQ6P1G2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Kdm2bQ6P1G2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Kdm2bQ6P1G2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Kdm2bQ6P1G2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Kdm2bQ6P1G2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Kdm2bQ6P1G2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Kdm2bQ6P1G2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Kdm2bQ6P1G2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Kdm2bQ6P1G2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Kdm2bQ6P1G2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Kdm2bQ6P1G2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Kdm2bQ6P1G2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm2bQ6P1G2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kdm2bQ6P1G2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Kdm2bQ6P1G2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Kdm2bQ6P1G2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Kdm2bQ6P1G2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Kdm2bQ6P1G2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Kdm2bQ6P1G2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Kdm2bQ6P1G2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Kdm2bQ6P1G2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kdm2bQ6P1G2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Kdm2bQ6P1G2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Kdm2bQ6P1G2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34,01■■■■□ 3,04
Kdm2bQ6P1G2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Kdm2bQ6P1G2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Kdm2bQ6P1G2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kdm2bQ6P1G2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Kdm2bQ6P1G2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33,94■■■■□ 3,02
Kdm2bQ6P1G2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Kdm2bQ6P1G2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Kdm2bQ6P1G2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Kdm2bQ6P1G2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Kdm2bQ6P1G2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Kdm2bQ6P1G2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Kdm2bQ6P1G2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33,85■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33,83■■■■□ 3,01
Kdm2bQ6P1G2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Kdm2bQ6P1G2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
Kdm2bQ6P1G2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Kdm2bQ6P1G2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Kdm2bQ6P1G2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Kdm2bQ6P1G2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Kdm2bQ6P1G2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33,78■■■■□ 3
Kdm2bQ6P1G2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Kdm2bQ6P1G2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,78■■■■□ 3
Kdm2bQ6P1G2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33,73■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Kdm2bQ6P1G2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Kdm2bQ6P1G2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Kdm2bQ6P1G2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Kdm2bQ6P1G2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Kdm2bQ6P1G2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Kdm2bQ6P1G2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Kdm2bQ6P1G2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Kdm2bQ6P1G2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Kdm2bQ6P1G2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Kdm2bQ6P1G2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Kdm2bQ6P1G2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Kdm2bQ6P1G2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Kdm2bQ6P1G2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Kdm2bQ6P1G2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Kdm2bQ6P1G2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
Kdm2bQ6P1G2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Kdm2bQ6P1G2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Kdm2bQ6P1G2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Kdm2bQ6P1G2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Kdm2bQ6P1G2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Kdm2bQ6P1G2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms