Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf9bQ6NZA9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf9bQ6NZA9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf9bQ6NZA9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf9bQ6NZA9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf9bQ6NZA9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf9bQ6NZA9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf9bQ6NZA9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf9bQ6NZA9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf9bQ6NZA9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf9bQ6NZA9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf9bQ6NZA9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf9bQ6NZA9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Taf9bQ6NZA9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf9bQ6NZA9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf9bQ6NZA9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf9bQ6NZA9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf9bQ6NZA9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms