Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Szrd1Q6NXN1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Szrd1Q6NXN1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Szrd1Q6NXN1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Szrd1Q6NXN1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Szrd1Q6NXN1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Szrd1Q6NXN1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Szrd1Q6NXN1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Szrd1Q6NXN1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Szrd1Q6NXN1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Szrd1Q6NXN1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Szrd1Q6NXN1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Szrd1Q6NXN1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Szrd1Q6NXN1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Szrd1Q6NXN1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Szrd1Q6NXN1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Szrd1Q6NXN1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Szrd1Q6NXN1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Szrd1Q6NXN1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms