Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med13lQ6JPI3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med13lQ6JPI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Med13lQ6JPI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med13lQ6JPI3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med13lQ6JPI3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med13lQ6JPI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Med13lQ6JPI3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med13lQ6JPI3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med13lQ6JPI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med13lQ6JPI3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med13lQ6JPI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Med13lQ6JPI3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med13lQ6JPI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med13lQ6JPI3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med13lQ6JPI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Med13lQ6JPI3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med13lQ6JPI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med13lQ6JPI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med13lQ6JPI3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms