Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpm4Q6IRU2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpm4Q6IRU2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tpm4Q6IRU2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tpm4Q6IRU2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpm4Q6IRU2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tpm4Q6IRU2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm4Q6IRU2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm4Q6IRU2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm4Q6IRU2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm4Q6IRU2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm4Q6IRU2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm4Q6IRU2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpm4Q6IRU2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpm4Q6IRU2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpm4Q6IRU2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tpm4Q6IRU2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpm4Q6IRU2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpm4Q6IRU2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tpm4Q6IRU2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm4Q6IRU2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm4Q6IRU2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm4Q6IRU2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm4Q6IRU2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm4Q6IRU2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm4Q6IRU2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpm4Q6IRU2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm4Q6IRU2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpm4Q6IRU2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm4Q6IRU2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms