Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Krt40Q6IFX3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Krt40Q6IFX3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Krt40Q6IFX3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Krt40Q6IFX3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Krt40Q6IFX3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Krt40Q6IFX3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Krt40Q6IFX3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Krt40Q6IFX3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Krt40Q6IFX3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Krt40Q6IFX3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Krt40Q6IFX3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Krt40Q6IFX3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Krt40Q6IFX3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Krt40Q6IFX3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Krt40Q6IFX3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Krt40Q6IFX3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Krt40Q6IFX3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Krt40Q6IFX3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Krt40Q6IFX3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Krt40Q6IFX3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Krt40Q6IFX3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Krt40Q6IFX3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Krt40Q6IFX3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Krt40Q6IFX3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Krt40Q6IFX3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Krt40Q6IFX3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Krt40Q6IFX3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Krt40Q6IFX3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Krt40Q6IFX3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Krt40Q6IFX3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Krt40Q6IFX3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Krt40Q6IFX3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Krt40Q6IFX3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Krt40Q6IFX3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Krt40Q6IFX3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Krt40Q6IFX3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Krt40Q6IFX3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Krt40Q6IFX3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Krt40Q6IFX3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Krt40Q6IFX3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Krt40Q6IFX3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Krt40Q6IFX3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Krt40Q6IFX3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Krt40Q6IFX3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Krt40Q6IFX3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Krt40Q6IFX3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Krt40Q6IFX3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Krt40Q6IFX3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Krt40Q6IFX3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Krt40Q6IFX3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Krt40Q6IFX3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Krt40Q6IFX3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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