Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud6aQ6IE21 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud6aQ6IE21 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud6aQ6IE21 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud6aQ6IE21 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud6aQ6IE21 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud6aQ6IE21 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud6aQ6IE21 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otud6aQ6IE21 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud6aQ6IE21 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud6aQ6IE21 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otud6aQ6IE21 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otud6aQ6IE21 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud6aQ6IE21 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otud6aQ6IE21 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud6aQ6IE21 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud6aQ6IE21 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud6aQ6IE21 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Otud6aQ6IE21 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6aQ6IE21 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6aQ6IE21 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6aQ6IE21 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud6aQ6IE21 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud6aQ6IE21 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud6aQ6IE21 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud6aQ6IE21 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otud6aQ6IE21 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud6aQ6IE21 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms