Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hist2h2aa1Q6GSS7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2aa1Q6GSS7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hist2h2aa1Q6GSS7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms