Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q6DFW0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q6DFW0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q6DFW0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q6DFW0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Q6DFW0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Q6DFW0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q6DFW0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q6DFW0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q6DFW0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Q6DFW0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q6DFW0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q6DFW0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q6DFW0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q6DFW0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q6DFW0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q6DFW0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q6DFW0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q6DFW0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q6DFW0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q6DFW0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q6DFW0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q6DFW0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q6DFW0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q6DFW0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q6DFW0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Q6DFW0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q6DFW0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q6DFW0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q6DFW0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q6DFW0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q6DFW0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q6DFW0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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