Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Cdk13Q69ZA1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37,04■■■■□ 3,52
Cdk13Q69ZA1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Cdk13Q69ZA1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Cdk13Q69ZA1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Cdk13Q69ZA1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Cdk13Q69ZA1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Cdk13Q69ZA1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Cdk13Q69ZA1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Cdk13Q69ZA1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36,92■■■■□ 3,5
Cdk13Q69ZA1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Cdk13Q69ZA1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36,88■■■■□ 3,49
Cdk13Q69ZA1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Cdk13Q69ZA1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Cdk13Q69ZA1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36,86■■■■□ 3,49
Cdk13Q69ZA1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36,86■■■■□ 3,49
Cdk13Q69ZA1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Cdk13Q69ZA1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Cdk13Q69ZA1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36,8■■■■□ 3,48
Cdk13Q69ZA1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Cdk13Q69ZA1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Cdk13Q69ZA1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Cdk13Q69ZA1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36,77■■■■□ 3,48
Cdk13Q69ZA1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cdk13Q69ZA1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cdk13Q69ZA1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cdk13Q69ZA1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Cdk13Q69ZA1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Cdk13Q69ZA1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Cdk13Q69ZA1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Cdk13Q69ZA1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Cdk13Q69ZA1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Cdk13Q69ZA1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36,63■■■■□ 3,45
Cdk13Q69ZA1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36,63■■■■□ 3,45
Cdk13Q69ZA1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Cdk13Q69ZA1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Cdk13Q69ZA1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Cdk13Q69ZA1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Cdk13Q69ZA1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Cdk13Q69ZA1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Cdk13Q69ZA1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Cdk13Q69ZA1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36,54■■■■□ 3,44
Cdk13Q69ZA1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Cdk13Q69ZA1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,52■■■■□ 3,44
Cdk13Q69ZA1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Cdk13Q69ZA1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Cdk13Q69ZA1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Cdk13Q69ZA1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Cdk13Q69ZA1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Cdk13Q69ZA1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Cdk13Q69ZA1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Cdk13Q69ZA1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Cdk13Q69ZA1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Cdk13Q69ZA1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Cdk13Q69ZA1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Cdk13Q69ZA1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Cdk13Q69ZA1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Cdk13Q69ZA1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36,29■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36,26■■■■□ 3,4
Cdk13Q69ZA1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Cdk13Q69ZA1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Cdk13Q69ZA1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Cdk13Q69ZA1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Cdk13Q69ZA1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Cdk13Q69ZA1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Cdk13Q69ZA1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Cdk13Q69ZA1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Cdk13Q69ZA1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Cdk13Q69ZA1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Cdk13Q69ZA1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,38
Cdk13Q69ZA1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cdk13Q69ZA1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cdk13Q69ZA1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cdk13Q69ZA1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cdk13Q69ZA1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Cdk13Q69ZA1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Cdk13Q69ZA1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Cdk13Q69ZA1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Cdk13Q69ZA1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36,07■■■■□ 3,36
Cdk13Q69ZA1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Cdk13Q69ZA1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Cdk13Q69ZA1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Cdk13Q69ZA1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,01■■■■□ 3,36
Cdk13Q69ZA1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Cdk13Q69ZA1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Cdk13Q69ZA1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35,98■■■■□ 3,35
Cdk13Q69ZA1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Cdk13Q69ZA1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Cdk13Q69ZA1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Cdk13Q69ZA1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35,93■■■■□ 3,34
Cdk13Q69ZA1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms