Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Sbno1Q689Z5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Sbno1Q689Z5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Sbno1Q689Z5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
Sbno1Q689Z5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Sbno1Q689Z5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Sbno1Q689Z5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Sbno1Q689Z5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sbno1Q689Z5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sbno1Q689Z5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sbno1Q689Z5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sbno1Q689Z5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Sbno1Q689Z5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Sbno1Q689Z5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sbno1Q689Z5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sbno1Q689Z5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Sbno1Q689Z5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Sbno1Q689Z5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Sbno1Q689Z5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sbno1Q689Z5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sbno1Q689Z5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sbno1Q689Z5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sbno1Q689Z5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sbno1Q689Z5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sbno1Q689Z5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sbno1Q689Z5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sbno1Q689Z5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sbno1Q689Z5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sbno1Q689Z5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sbno1Q689Z5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Sbno1Q689Z5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Sbno1Q689Z5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sbno1Q689Z5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Sbno1Q689Z5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Sbno1Q689Z5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Sbno1Q689Z5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sbno1Q689Z5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sbno1Q689Z5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sbno1Q689Z5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sbno1Q689Z5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sbno1Q689Z5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Sbno1Q689Z5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Sbno1Q689Z5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Sbno1Q689Z5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Sbno1Q689Z5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Sbno1Q689Z5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Sbno1Q689Z5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sbno1Q689Z5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sbno1Q689Z5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Sbno1Q689Z5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Sbno1Q689Z5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Sbno1Q689Z5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sbno1Q689Z5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sbno1Q689Z5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sbno1Q689Z5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sbno1Q689Z5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sbno1Q689Z5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sbno1Q689Z5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sbno1Q689Z5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sbno1Q689Z5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sbno1Q689Z5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sbno1Q689Z5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sbno1Q689Z5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sbno1Q689Z5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sbno1Q689Z5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Sbno1Q689Z5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Sbno1Q689Z5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Sbno1Q689Z5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Sbno1Q689Z5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sbno1Q689Z5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sbno1Q689Z5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sbno1Q689Z5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sbno1Q689Z5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sbno1Q689Z5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sbno1Q689Z5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Sbno1Q689Z5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Sbno1Q689Z5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Sbno1Q689Z5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sbno1Q689Z5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms