Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nlrp9bQ66X22 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nlrp9bQ66X22 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Nlrp9bQ66X22 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nlrp9bQ66X22 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nlrp9bQ66X22 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nlrp9bQ66X22 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Nlrp9bQ66X22 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nlrp9bQ66X22 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nlrp9bQ66X22 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nlrp9bQ66X22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nlrp9bQ66X22 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Nlrp9bQ66X22 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nlrp9bQ66X22 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nlrp9bQ66X22 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Nlrp9bQ66X22 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nlrp9bQ66X22 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nlrp9bQ66X22 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Nlrp9bQ66X22 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nlrp9bQ66X22 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nlrp9bQ66X22 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nlrp9bQ66X22 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nlrp9bQ66X22 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nlrp9bQ66X22 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nlrp9bQ66X22 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nlrp9bQ66X22 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nlrp9bQ66X22 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nlrp9bQ66X22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nlrp9bQ66X22 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nlrp9bQ66X22 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Nlrp9bQ66X22 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Nlrp9bQ66X22 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nlrp9bQ66X22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nlrp9bQ66X22 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nlrp9bQ66X22 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nlrp9bQ66X22 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nlrp9bQ66X22 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nlrp9bQ66X22 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nlrp9bQ66X22 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nlrp9bQ66X22 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nlrp9bQ66X22 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nlrp9bQ66X22 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nlrp9bQ66X22 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nlrp9bQ66X22 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nlrp9bQ66X22 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nlrp9bQ66X22 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms